Eaux usées, cas et hospitalisations COVID-19 en France (2022-2023), vus par pyvoa
DINUM — Licence Ouverte / Etalab 2.0. Publication d'origine, 30 octobre 2026.
L'essentiel
- À partir de 2023, les cas décrochent des eaux usées et des hospitalisations : la vague du printemps 2023 atteint 37 % de son maximum dans les eaux usées, 13 % seulement dans les cas.
- C'est ce qu'on attend de la baisse du dépistage après la fin de son remboursement intégral (1er mars 2023) : un artefact de déclaration que la comparaison fait apparaître.
- L'indicateur retenu est celui des 12 stations suivies depuis 2022 (celui des 54 stations ne commence qu'en février 2024).
- Les indicateurs nationaux de Santé publique France (cas, hospitalisations) s'arrêtent au 30 juin 2023.
Phrases relevées telles quelles dans le texte officiel reproduit ci-dessous (DINUM, Licence Ouverte / Etalab 2.0).
Texte officiel intégral
Ci-dessous, le corps complet de la publication de DINUM, reproduit sans modification. La Licence Ouverte / Etalab 2.0 en autorise expressément la reproduction, à la seule condition d'en mentionner la paternité.
Le signal du SARS-CoV-2 dans les eaux usées (dispositif SUM'Eau de Santé publique France) confronté, semaine après semaine, aux cas confirmés et aux nouvelles hospitalisations pour COVID-19 déclarés par Santé publique France, sur toute la période que les deux sources ont en commun : d'août 2022 à juin 2023, trois vagues.
Ce que montre la figure. À gauche, les trois séries en moyenne hebdomadaire, rapportées à leur maximum ; à droite, la corrélation de chacune avec les eaux usées selon le décalage, en semaines.
- Les cas confirmés évoluent en même temps que les eaux usées (corrélation maximale de 0,85, sans décalage).
- Les hospitalisations les suivent d'environ une semaine (0,91 à une semaine ; six jours à la résolution quotidienne, de quatre à onze selon la vague), ce qui rejoint l'avance d'une à deux semaines sur les passages aux urgences que rapporte le réseau SUM'Eau (Jourdain et al., Microorganisms, 2025, doi:10.3390/microorganisms13020281 ).
- À partir de 2023, les cas décrochent des eaux usées et des hospitalisations : la vague du printemps 2023 atteint 37 % de son maximum dans les eaux usées, 13 % seulement dans les cas. C'est ce qu'on attend de la baisse du dépistage après la fin de son remboursement intégral (1er mars 2023) : un artefact de déclaration que la comparaison fait apparaître.
Précautions. Les eaux usées sont prélevées une fois par semaine : le décalage n'est connu qu'à la semaine près. L'indicateur SUM'Eau est lissé par Santé publique France sur les semaines qui précèdent et qui suivent : le lissage ne retarde pas le signal, mais l'avance mesurée ici l'est a posteriori, ce n'est pas celle d'une alerte en temps réel. L'indicateur retenu est celui des 12 stations suivies depuis 2022 (celui des 54 stations ne commence qu'en février 2024).
Le code. pyvoa, bibliothèque Python libre d'analyse de données épidémiologiques, lit les deux sources avec la même grammaire et les rend dans le même format, indexé par date et par lieu : la comparaison elle-même n'est que du pandas.
Les données. Santé publique France publie désormais SUM'Eau sur son portail Odissé ; le fichier de data.gouv.fr n'est plus mis à jour depuis début 2026. pyvoa lit par défaut une copie figée déposée sur Zenodo ( doi:10.5281/zenodo.23822170 ), et Odissé directement en mode live ( pf.setlive(True) ). Les indicateurs nationaux de Santé publique France (cas, hospitalisations) s'arrêtent au 30 juin 2023.
Fin du texte officiel repris
Source :DINUM, publié le — Licence Ouverte / Etalab 2.0.
Consulter la publication d'originehttps://www.data.gouv.fr/reuses/eaux-usees-cas-et-hospitalisations-covid-19-en-france-2022-2023-vus-par-pyvoa
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